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李婧

教授

  • 电话:+86-021-34204348
  • 邮箱:jing.li@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市东川路800号交通大学闵行校区生命学院4-221室
  • 实验室网址:http://cbb.sjtu.edu.cn/~jingli/

学术经历

  •  2007年至2010年为美国范德堡大学生物医学信息学系博士后。
  • 2010年起历任ebet生物信息与生物统计学系副教授、教授。

研究方向

蛋白质组学生物信息学

蛋白质组学生物信息学

组学数据统计

组学数据统计

生物信息软件与数据库开发

生物信息软件与数据库开发

代表论著

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    B.Liu, S.Jiang, M.Li, X.Xiong, M.Zhu, D.Li, L.Zhao, L.Qian, L.Zhai, J.Li, H.Lu, S.Shan, J.Lin, Y.Lu, X.Li, M.Tan. Proteome-wide analysis of USP14 substrates revealed its role in hepatosteatosis via stabilization of FASN. Nature Communications. 9(1),4770, 2018. 

    ?  

    X.Yi,B.Wang, Z.An, F.Gong, J.Li*, Y. Fu*. Quality control of single amino acid variations detected by tandem mass spectrometry. Journal of Proteomics. 187,144-151, 2018. 

    ?  

    W.Wang, R. Mauleon,Z.Hu,D.Chebotarov, S.Tai,Z.Wu, ..., J.Li, et al. Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice. Nature. 557(7703),43-49, 2018. 

    ?  

    B.Wang, J.Li, X.Cheng, Q.Zhou, J.Yang, M.Zhang, H.Chen, J.Li*. NIPS, a 3D network-integrated predictor of deleterious protein SAPs, and its application in cancer prognosis. Scientific Reports. 8:6021, 2018. 

    ?  

    J.Xiao,A.Tanca, B.Jia, R.Yang, B.Wang,Y.Zhang J.Li*. Metagenomic Taxonomy-Guided Database-Searching Strategy for Improving Metaproteomic Analysis. Journal of Proteome Research. 6;17(4):1596-1605, 2018. 

  • ?  

    M.Lei, J.Xu, LC.Huang, L.Wang, J.Li*. Network module-based model in the differential expression analysis for RNA-seq. Bioinformatics. 33(17):2699-2705, 2017. 

    ?  

    M.Zhang, B.Wang, J.Xu, X.Wang, L.Xie, B.Zhang*, Y.Li*, J.Li*. CanProVar 2.0: An Updated Database of Human Cancer Proteome Variation. Journal of Proteome Research. 16(2):421-432, 2017. 

    ?  

    M.Zhang, H.Li, Y.He, H.Sun, L.Xia, L.Wang, B.Sun, L.Ma, G.Zhang, J.Li*, Y.Li*, L.Xie*. Construction and Deciphering of Human Phosphorylation-Mediated Signaling Transduction Networks. Journal of Proteome Research 14(7):2745-57, 2015.

    ?  

    J. Xu, L. Wang, J. Li*. Biological network module-based model for the analysis of differential expression in shotgun proteomics. Journal of Proteome Research. 13 (12): 5743-50, 2014.

    ?  

    Q. Wang, S. Zhang, S. Pang, M. Zhang, B. Wang, Q. Liu*,J. Li*. GroupRank: Rank Candidate Genes in PPI Network by Differentially Expressed Gene Groups. PLoS One. 9(10): e110406, 2014.

  • 近年主持科研项目:
  • 国家自然科学基金面上项目:含缺失值的定量蛋白质组修饰谱差异分析方法研究(2019.1-2022.12,59万)
  • 国家自然科学基金面上项目:高通量蛋白质组pQTL鉴定新方法研究及在癌症中的应用 (2013.1-2016.12, 80万)
  • 国家自然科学基金青年基金项目:基于生物网络模块的高通量表达谱差异分析(2011.1-2013.12, 22万)
  • 农业部重大专项:外源基因和蛋白潜在过敏性分析技术 (2016.1-2020.12, 204万) 
  • 国家重大科学研究计划 973 项目子课题: 代谢生理活动与病理过程中信号转导网络的系统生物学研究 (2011.1-2015.8, 63万)
  • 上海市浦江人才计划 (2012.7- 2015.7, 20万)

承担项目